基因芯片（又稱 DNA 芯片、生物芯片）技術就是順應這一科學發展要求的產物，它的出現為解決此類問題提供了光輝的前景。該技術系指將大量（通常每平方厘米點陣密度高于 400 ）探針分子固定于支持物上后與標記的樣品分子進行雜交，通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。通俗地說，就是通過微加工技術 ，將數以萬計、乃至百萬計的特定序列的DNA片段（基因探針），有規律地排列固定于2cm2 的硅片、玻片 等支持物上，構成的一個二維DNA探針陣列，與計算機的電子芯片十分相似，所以被稱為基因芯片。基因芯片主要用于基因檢測工作 。

正如電子管電路向晶體管電路和集成電路發展時所經歷的那樣，核酸雜交技術的集成化也已經和正在使分子生物學技術發生著一場革命。現在全世界已有十多家公司專門從事基因芯片的研究和開發工作，且已有較為成型的產品和設備問世。主要代表為美國 Affymetrix 公司。該公司聚集有多位計算機、數學和分子生物學，其每年的研究經費在一千萬美元以上，且已歷時六七年之久，擁有多項。

基因芯片又稱為DNA微陣列(DNA microarray)，可分為三種主要類型：1）固定在聚合物基片（尼龍膜，纖維膜等）表面上的核酸探針或cDNA片段，通常用同位素標記的靶基因與其雜交，通過顯影技術進行檢測。這種方法的優點是所需檢測設備與目前分子生物學所用的顯影技術相一致,相對比較成熟。但芯片上探針密度不高，樣品和試劑的需求量大，定量檢測存在較多問題。

與其他芯片制作技術相比較，微珠芯片具有如下優勢:

(1) 密度高微珠芯片的點樣密度是原位光合成法的16倍，噴點法的100倍，接觸式點樣的400倍。

(2)測試重復性好鑒 于超高密度的特點，微珠芯片中每個樣品都能保證約30個重復，從而保證測試的高重復性、高重復串以及高可靠性。

(3)定制方便若需要在已完成的芯片中增加測試點或新基因，只要合成相應的微珠加入到微珠混合池中即可。

(四)基因芯片數據分析

基因芯片分析包括五個基本步驟:生物學問題、樣品制備、生物化學反應、檢測、數據模型分析。基因芯片數據分析包括兩部分，數據可靠性分析和生物學意義分析。