菌落的裂解及DNA結合于纖維素濾膜
(1) 在一張保鮮膜上制作一個裝有0.5mol/L NaOH的小洼(0.75ml),使菌落面朝上,將濾膜放到小洼上,展平保鮮膜,使濾膜均勻濕潤,讓濾膜留于原處2-3分鐘。
(2) 用干紙巾從濾膜的下方吸干濾膜,用一張新的保鮮膜和新配制的0.5mol/L NaOH重復步驟(1)。
(3) 吸干濾膜,將濾膜轉移到新的帶有1mol/L Tris·Cl(pH7.4)的保鮮膜洼上。5分鐘后吸干濾膜,再重復一次該步驟。
(4) 吸干濾膜,把它轉移到有1.5mol/L NaCl、0.5mol/L Tris·Cl (pH7.4)的保鮮膜小洼上5分鐘后吸干濾膜,轉移到一張干的濾紙上,置于室溫20-30分鐘,使濾膜干燥。
(5) 將濾膜夾在兩張干的濾紙之間,在真空烤箱中于80℃干烤2小時,固定DNA。
(6) 將固定在膜上的DNA與32 P標記的RNA進行雜交。
DNA 探針為原位雜交提供較高的靈敏度。與RNA探針相比,DNA探針與靶mRNA 分子的雜交強度較弱,因此在雜交后的洗滌中不應使用甲醛。
探針特異性至關重要。如果已知細胞中mRNA或DNA的確切核苷酸序列,則可據此設計高度的互補探針。如果超過 5% 的堿基對不互補,那么探針只能與靶序列發生輕度雜交。這意味著,探針更容易在洗滌和檢測步驟中被洗去,可能無法正確檢測。
原位雜交(In situ hybridazation)
固定
收集斑馬魚的胚胎,在Holfretor水中培養,到達所需要的發育時期時,用蛋白酶去除卵膜,用4%多聚甲醛固定,在4℃保存,二十四小時后用50%2%多聚甲醛溶液洗,然后換成,在-20C 保存,待用(兩天和兩天以上的胚胎需要用處理,去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培養,可阻斷色素的形成)
植物原位雜交在遺傳育種方面的應用主要包括:
檢測物種或品種特異性:通過植物原位雜交技術可以檢測出不同物種或品種之間基因表達的差異,從而為物種或品種特異性研究提供依據。
遺傳育種:通過植物原位雜交技術可以檢測到不同品種之間基因表達的差異,從而為遺傳育種提供重要的參考信息。例如,通過將特定的外源基因導入到植物細胞中,然后利用原位雜交技術檢測該基因在植物細胞中的位置和表達情況,為遺傳育種提供重要的參考信息。